PCR 儀器有多種分類方法，具體如下：

一、根據 DNA 擴增的目的和檢測標準分類

1、普通 PCR 儀：一次 PCR 擴增只能運行一個特定退火溫度，主要用于簡單的、對目的基因退火溫度的擴增，應用于科學研究、教學、醫學臨床、檢驗檢疫等機構。

2、梯度 PCR 儀：一次性 PCR 擴增可設置一系列不同的退火溫度條件，通常有 12 種溫度梯度，用于研究未知 DNA 退火溫度的擴增，可節約成本和時間，也可在不設置梯度時當作普通 PCR 儀使用，多應用于科研、教學機構。

3、原位 PCR 儀：用于從細胞內靶 DNA 的定位分析，可保持細胞或組織的完整性，使 PCR 反應體系滲透到組織和細胞中，在細胞的靶 DNA 所在位置進行基因擴增，對于在分子和細胞水平上研究疾病的發病機理、臨床過程及病理轉變有重大實用價值，主要應用于臨床、科研領域。

4、實時熒光定量 PCR 儀：在普通 PCR 儀基礎上增加了熒光信號采集系統和計算機分析處理系統，PCR 擴增時加入的引物利用同位素、熒光素等進行標記，使用引物和熒光探針同時與模板特異性結合擴增，擴增結果通過熒光信號采集系統實時采集信號并輸送到計算機分析處理系統，得出量化的實時結果輸出，主要用于醫學臨床檢測、生物醫藥研發、食品行業、科研院校等機構。

二、根據 DNA 擴增時升溫介質分類

1、變溫鋁塊式 PCR 儀：以電阻絲、導電熱膜、熱泵式珀爾帖半導體元件等為熱源，通過升溫帶有凹孔的鋁塊，利用自來水、制冷壓縮機或半導體來降溫。優點是溫度傳導快，各管擴增一致性好；缺點是壓縮機制冷重量大、啟動慢等。實時熒光定量 PCR 儀

2、水浴式 PCR 儀：以水為傳熱介質，通過機械裝置將帶有反應管的架子在 3 個不同溫度的水浴中移位和升降溫度，實現溫度循環。優點是溫度易恒定，熱容量大，擴增效果穩定；缺點是高溫水浴不穩定，改變水浴溫度耗時較長。

3、變溫式流式 PCR 儀：依據空氣流的動力學原理，以冷熱氣流為介質升降溫度。優點是變溫迅速，適合微量、快速 PCR，反應器不受形狀限制；缺點是難以控制低溫，有較多空氣流動力學要求。

三、根據實時熒光定量 PCR 儀的結構分類

1、金屬板式實時定量 PCR 儀：可作為普通 PCR 儀使用，部分帶梯度功能，能容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，存在邊緣效應，標準曲線的反應條件難以與樣品一致。

2、離心式實時定量 PCR 儀：PCR 擴增樣品槽被設計為離心轉子，溫度均一性好，使用同一個激發光源和檢測器，可隨時檢測旋轉到跟前的樣品，能有效減少系統誤差，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細管作樣品管，增加了使用成本，且不帶梯度功能。

3、各孔獨立控溫的定量 PCR 儀：不同樣品槽分別擁有獨立的智能升降溫模塊，各孔獨立控溫，適合多指標快速檢測，可實現任意梯度反應，但上樣不如傳統方法方便，且需要特殊的扁平反應管，使用成本較高。

PCR儀器種類多樣，選擇時需根據實驗需求、通量和預算進行權衡。